宁康元年（公元373 年，癸酉年）
春天正月己丑初一，朝廷宣布大赦天下，还改了年号。
二月，大司马桓温来京城朝见皇帝。辛巳日，皇帝下诏让吏部尚书谢安、侍中王坦之到新亭迎接。那时候，京城人心惶惶的，有人传言说桓温要杀王坦之、谢安，然后改朝换代。王坦之害怕得不行，谢安却神色镇定，说：“晋朝的存亡，就看这一趟了。”桓温到了之后，百官都在路边跪拜。桓温带着好多士兵护卫，接见朝中大臣，那些有名望的大臣都吓得浑身发抖，脸色大变。王坦之紧张得汗水湿透了衣服，手版都拿反了。谢安却从容地就座，坐好后对桓温说：“我听说诸侯要是有道义，周边的邻居都会来守护，您干嘛要在墙壁后面藏人呢！”桓温笑着说：“我也是没办法呀。”于是让左右把藏着的人撤了，和谢安谈笑了很久。郗超平常是桓温的主要谋士，谢安和王坦之去见桓温时，桓温让郗超躺在帐子里偷听他们说话。一阵风吹开了帐子，谢安笑着说：“郗超可真是个入幕之宾啊。”当时皇帝年幼，外面又有桓温这样的权臣，多亏谢安和王坦之尽忠辅佐护卫，才让晋朝安稳下来。
温处理卢悚入宫这件事，把尚书陆始抓起来交给廷尉，还免去了桓秘的官职，受牵连的人很多；同时提升毛安之为右卫将军，桓秘因此怨恨桓温。
三月，桓温生病了，在建康停留了十四天，甲午日，回到姑孰。
夏天，代王什翼犍派燕凤到前秦进贡。
秋天七月己亥日，南郡宣武公桓温去世。
之前，桓温病重的时候，暗示朝廷给他加九锡（古代帝王赐给有大功或有权势的诸侯大臣的九种礼器，是一种极高的礼遇），还多次派人去催。谢安、王坦之故意拖延，让袁宏起草加九锡的诏书。袁宏把草稿给王彪之看，王彪之感叹文章写得好，接着说：“你确实有大才，但这种东西怎么能随便示人呢！”谢安看到草稿后，就不停地修改，结果过了十几天还没完成。袁宏私下和王彪之商量，王彪之说：“听说他病情越来越严重，估计也撑不了多久了，不妨再稍微拖延一下。”袁宏就听了他的。
桓温的弟弟江州刺史桓冲，问桓温谢安、王坦之该怎么安排，桓温说：“他们不是你能安排得了的。”桓温心里觉得，自己活着的时候，他们肯定不敢有什么不同意见，自己死了，桓冲也管不了他们；要是杀了他们，对桓冲也没好处，还会失去人心。
桓温因为世子桓熙才能平庸，就让桓冲统领他的部众。于是桓秘和桓熙的弟弟桓济商量一起杀桓冲，桓冲暗中知道了这件事，不敢进宫。没过多久，桓温去世，桓冲先派大力士把桓熙、桓济抓起来，然后才去处理丧事。桓秘就被闲置一边，桓熙、桓济都被流放到长沙。朝廷下诏按照汉朝霍光和安平献王的旧例安葬桓温。桓冲宣称这是桓温的遗命，让小儿子桓玄继承爵位，当时桓玄才五岁，就继承了南郡公的封号。
庚戌日，朝廷给右将军、荆州刺史桓豁加征西将军的称号，让他都督荆、杨、雍、交、广五州诸军事。任命江州刺史桓冲为中军将军、都督扬、豫、江三州诸军事以及扬、豫二州刺史，镇守姑孰；竟陵太守桓石秀为宁远将军、江州刺史，镇守寻阳。桓石秀是桓豁的儿子。桓冲接替桓温的职位后，一心忠于朝廷，有人劝桓冲杀掉那些有名望的人，独揽大权，桓冲没有听从。以前桓温在地方镇守时，判人死刑都是自己决定，不向朝廷请示。桓冲觉得生杀大权应该归朝廷，凡是判处死刑的，都先上报，等朝廷批复后，再执行。
谢安因为皇帝年幼，刚刚又失去了首辅大臣桓温，就想请崇德太后临朝听政。王彪之说：“以前皇帝还在襁褓中，母子一体，所以太后可以临朝；但太后也不能独自决断事情，还是要咨询大臣。现在皇上已经十岁多了，快到行冠礼和结婚的年纪了，反而让嫂子临朝，会让人觉得皇上弱小，这怎么能彰显皇上的圣德呢！你们要是非要这么做，我也没办法，我只是可惜国家的大体统罢了。”谢安不想把大权交给桓冲，所以想让太后临朝，
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