司令部下设四大核心部门：
一、参谋部，仍由殷承瓛兄兼任部长。下设作战科、情报科、地图科。负责制定作战计划、进行情报分析、精确兵力调度。”
殷承瓛起身领命：“定不辱使命！”
“二、军法处，我意原军法处副处长，杜明哲兄出任处长。”林景云看向一位面容刚正的中年军官，“明哲兄执法严明，刚正不阿，正是不二人选。军法处负责全军纪律监察、战场执法、以及未来的战俘管理。”
杜明哲肃然起立：“景帅信任，明哲必竭尽所能，维护军纪！”
“三、新设立军事训练处，由胡若愚兄担任处长。”林景云的目光转向一位年轻英武的将领，“若愚兄在讲武堂时便以精通训练着称。军事训练处负责新兵招募与基础训练，协助参谋部制定全军整训大纲，定期考核各部队战力，并组织大规模军事演习。骑兵的专项训练，也将由该处负责。”
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胡若愚眼中闪烁着兴奋的光芒：“谢景帅栽培！若愚定为云南训练出一支精兵！”
“四、后勤装备部，继续由庾恩旸兄负责。”林景云看向庾恩旸，“泽普兄肩上的担子最重。武器弹药的调配，尤其是步枪、机枪、马刀的及时补充；军马的饲料，我要求每匹马每日至少保证三斤精料；以及全体将士的被装等单兵装备补给，都由后勤装备部统一筹划管理。”
庾恩旸郑重道：“请景帅放心，后勤装备部定会保障全军所需，不让将士们空手上阵，饿着肚子打仗！”
林景云满意地点点头：“此外，为严肃军纪，整肃军容，我决定加强宪兵队伍建设，将我军已有，隶属军法处的宪兵队进行扩编，组建一支独立宪兵总队，编制六百人，仍隶属于军法处，由杜明哲兄节制。宪兵总队统筹全省宪兵行动，下设三个大队，分布于重要城市与军事要地。”
这个决定让众人微微有些意外，但细想之下，又觉十分必要。一支独立的宪兵力量，对于维护军队纪律，将起到至关重要的作用。
接着，林景云开始阐述他对全省武装力量的分类规划。
“将原地方部队巡防营的功能进行拆分，一分为二，分别组建保安旅、警察厅。今后，云南的武装力量，将明确划分为三类：
第一类，常备军。即我们已经组建的西南边防军第1军、第3军，以及战区司令部直属的苍狼营、黑旗营、独立骑兵旅、炮兵旅、辎重营、通信营、工兵营、防化部队和边防守卫部队等。这些部队，是我们的拳头，是我们的尖刀！他们的唯一职责，就是维护国家领土与主权完整，歼灭任何敢于来犯之敌！”
他语气铿锵，掷地有声：“其中，西南边防军第1军，定位为野战主力，以山地、高原、平原、丘陵地带和巷战作战为主，侧重于强大的正面攻防能力与战场机动、城市巷战作战能力。第3军，则定位山地守备、丛林作战主力，依托高原与丛林复杂地形，侧重于坚固防御工事的构筑与灵活的小分队游击作战。”
将领们听得热血沸腾，这样的划分，使得各部队的作战目标更加清晰。
“第二类，保安旅。这是我们的地方保卫力量。”林景云继续道，“保安旅的主要职责是保境安民，清剿地方匪患，协助警察厅缉捕武装暴徒。将原有的各地方巡防营、团练、自卫队、保安队、护路队，统一整编纳入保安旅体系，巡防营、团练、自卫队、保安队整编为保安团。保安团负责驻扎各城镇及主要交通线路的关卡，护路总队则依据茶马古道等重要商路布防，特别是通往西藏、新疆等地的马帮商路，要确保沿途的武装威慑，及时剿灭匪盗，并对有需要的商队提供救助。”
商人们出身的官员听到这里，脸上露出了欣慰的笑容。商路的安全，直接关系到云南的经济命脉。
“第三类，警察厅。抽调讲武堂毕业生、原巡防营熟悉治安管理、品行善良、刚正不阿人员组建。”林景云的目光转向李根源，他目前兼着民政部长，“警察厅归属省公署管辖，
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